集美大学理学院于2007年获得应用数学二级学科硕士点，2011年获数学一级学科硕士点，2012年获得福建省重点学科建设，设有1个省部级实验教学示范中心（信息与计算科学）、1个数学与系统科学研究所、1个国际学术审稿中心（集美大学模糊数学审稿中心）、1个研究中心（复杂系统研究中心）。理学院现有学术型硕士生指导教师49人，其中具有博导资格教师8人。数学一级学科硕士点培养方向和指导教师如下：
070101 基础数学
王保祥（博导、硕导）、郭炜超、蓝永艺、李锦玲、孙丽玲、陈阳、甘宁、曹慧芹、连佳丽、陈杰、陈晓玲、陆玉锋、戴祎琛
070102 计算数学
陈景华、陈雪娟、叶星旸
070103 概率论与数理统计
倪文清、蔡南莲
070104 应用数学
黄振坤（博导、硕导）、魏春金（博导、硕导）、宾红华、赵玲、黄荣生、王海峰、娜菲莎·吐尔逊、林秋宝、杨兰、王秀琳、周昌杰、张秀钦、陈晓伟、蔡晓梅、雷国伟、彭东青、朱会丽、王敏帅、蔡宏浩、黄伟城、杨国玉、程梅娟
070105 运筹学与控制论
晏卫根（博导、硕导）、陈海燕（博导、硕导）、林丽双（博导、硕导）、徐丽琼、冯星
070106 智能信息处理
卓双木（博导、硕导）、谢加良（博导、硕导）、陈芝花（博导、硕导）、刘小辉、李青岩、张东晓、孔庆钊、畅航、李凤
